Cytoscape Desktop MCP

Drive a running Cytoscape Desktop to load, lay out, and style biological networks.

这个条目提供什么？

Cytoscape Desktop MCP 是 ChatHome Skills 收录的 MCP 条目，来源为 Official MCP Registry，质量分 73/100。作为 Model Context Protocol 服务器，它向 Claude、Cursor、Copilot 等兼容 MCP 的 LLM 客户端暴露可直接调用的工具，让 agent 的能力超出模型内置范围。该条目由 ChatHome Skills 的每日抓取从官方 registry 和 GitHub 发现查询中收录，每次运行都会重新核验仓库事实、新鲜度信号和安装元数据。质量分综合了官方 registry 收录情况、可用安装命令、许可证完整性、仓库活跃度和 GitHub star 趋势，完整算法说明见来源页。安装命令已列于上方，可直接复制使用。在将 Cytoscape Desktop MCP 加入生产 agent 工作流前，请核对上方的最近更新日期和仓库状态——下方事实快照是最近一次抓取的时点值。

事实快照

来源: Official MCP Registry
质量: 73/100
安装方式: npm
仓库: cytoscape/cytoscape-desktop-mcp
仓库更新: 2026年8月11日

安装命令

npx -y @cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge@1.0.3

安装方式: npm

运行此命令前，请先核对上游源码。

GitHub 项目

质量

仓库 Stars

仓库更新

2026年8月11日

质量分如何计算？

由六个维度加权得出，满分 100。
来源可信度（25）：是否收录于官方或精选 registry。
可安装性（25）：可直接运行的命令 > 已声明传输方式 > 仅源码。
维护活跃度（20）：最近推送时间；已归档条目此项为 0。
采用度（20）：仓库 star 数，按对数曲线计分。
文档完整性（10）与描述质量（10）：是否有已解析的 manifest 或 SKILL.md frontmatter，以及是否为真实描述而非占位文本。
某个来源结构上无法提供的维度（registry 不提供 star 和许可证）不计入该条目的平均分，而不是记为 0 分，因此不同来源的条目仍可横向比较。

MCP manifest

{
  "_meta": {
    "io.modelcontextprotocol.registry/official": {
      "status": "active",
      "isLatest": true,
      "updatedAt": "2026-08-11T20:08:17.855626Z",
      "publishedAt": "2026-08-11T20:08:17.855626Z",
      "statusChangedAt": "2026-08-11T20:08:17.855626Z"
    }
  },
  "server": {
    "name": "io.github.cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge",
    "title": "Cytoscape Desktop MCP",
    "$schema": "https://static.modelcontextprotocol.io/schemas/2025-12-11/server.schema.json",
    "version": "1.0.3",
    "packages": [
      {
        "transport": {
          "type": "stdio"
        },
        "fileSha256": "587db028294397065f071af1b0d2130daaf26be14fd936c9d540dc1cacf00d3c",
        "identifier": "https://github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp/releases/download/mcpb-v1.0.3/cytoscape-mcp.mcpb",
        "registryType": "mcpb",
        "environmentVariables": [
          {
            "name": "CYREST_PORT",
            "default": "1234",
            "description": "Port Cytoscape Desktop's REST interface listens on (Edit > Preferences > REST API)"
          }
        ]
      },
      {
        "version": "1.0.3",
        "transport": {
          "type": "stdio"
        },
        "identifier": "@cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge",
        "registryType": "npm",
        "environmentVariables": [
          {
            "name": "CYREST_PORT",
            "default": "1234",
            "description": "Port Cytoscape Desktop's REST interface listens on (Edit > Preferences > REST API)"
          }
        ]
      }
    ],
    "repository": {
      "url": "https://github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp",
      "source": "github"
    },
    "websiteUrl": "https://github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp",
    "description": "Drive a running Cytoscape Desktop to load, lay out, and style biological networks."
  }
}

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